آزمایشگاه این مرکز دارای تجهیزات مورد نیاز بیمارستان زنان بوده و شامل بخش های :پذیرش، هماتولوژی و انعقاد، میکروب شناسی، بیوشیمی خون،
انگل شناسی،نمونه گیری، کنترل کیفی، آنالیز ادرار،سرولوژی، پاتولوژی،هورمون و جوابدهی می باشد .